Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms