Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Shq1Q7TMX5 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Shq1Q7TMX5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Shq1Q7TMX5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Shq1Q7TMX5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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