Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms