Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
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