Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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