Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clcn1Q64347 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms