Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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AtmQ62388 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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AtmQ62388 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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