Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ulk4Q3V129 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms