Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms