Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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