Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccndbp1Q3TVC7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccndbp1Q3TVC7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccndbp1Q3TVC7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms