Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccbe1Q3MI99 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccbe1Q3MI99 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms