Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms