Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ldlr-202ENSMUST00000213114 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms