Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cntn3Q07409 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cntn3Q07409 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Cntn3Q07409 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cntn3Q07409 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cntn3Q07409 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cntn3Q07409 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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