Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Thbs3Q05895 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms