Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxd1Q01822 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxd1Q01822 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxd1Q01822 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxd1Q01822 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxd1Q01822 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxd1Q01822 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hoxd1Q01822 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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