Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mc1rQ01727 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms