Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gja5Q01231 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms