Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AlkP97793 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AlkP97793 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AlkP97793 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlkP97793 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms