Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RptnP97347 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RptnP97347 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RptnP97347 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms