Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Otx2P80206 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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