Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms