Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Irf5P56477 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Irf5P56477 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Irf5P56477 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Irf5P56477 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Irf5P56477 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf5P56477 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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