Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 960 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fgd1P52734 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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