Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx2P48031 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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