Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SrprbP47758 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SrprbP47758 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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SrprbP47758 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SrprbP47758 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SrprbP47758 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SrprbP47758 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SrprbP47758 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SrprbP47758 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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