Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VhlP40338 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
VhlP40338 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms