Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RxraP28700 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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