Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pde6aP27664 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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