Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms