Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P20040 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P20040 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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