Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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NelfeP19426 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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NelfeP19426 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms