Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18526 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18526 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
P18526 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18526 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms