Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Irf1P15314 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Irf1P15314 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Irf1P15314 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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