Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2-Ab1P01921 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms