Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-AaP01910 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms