Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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