Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ascl4M0QW46 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ascl4M0QW46 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ascl4M0QW46 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ascl4M0QW46 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ascl4M0QW46 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ascl4M0QW46 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ascl4M0QW46 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ascl4M0QW46 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms