Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fam228a-204ENSMUST00000222363 2284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 4933423L19Rik-201ENSMUST00000208432 1464 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm20642-201ENSMUST00000177185 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Zfp82-207ENSMUST00000183190 1906 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms