Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Smim18J3QNP2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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