Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms