Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm8005F6YKY3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms