Protein–RNA interactions for Protein: F6W8I0

Yjefn3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yjefn3F6W8I0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yjefn3F6W8I0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms