Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CenpfE9Q3P4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms