Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm3543D3Z235 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm3543D3Z235 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm3543D3Z235 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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