Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssxb8B1AY40 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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