Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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PtprfA2A8L5 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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