Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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