Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms